پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 25 |
| تعداد شماره‌ها | 960 |
| تعداد مقالات | 7,934 |
| تعداد مشاهده مقاله | 13,425,489 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 9,544,071 |
بررسی مولکولی ژن های algD، lasR و rhlR در ایزوله های Pseudomonas aeruginosa جداسازی شده از بیماران بستری در بیمارستان | ||
| زیست شناسی کاربردی | ||
| دوره 38، شماره 2 - شماره پیاپی 38، تیر 1404 | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22051/jab.2024.48523.1652 | ||
| نویسندگان | ||
| حسین عظیم خومان1؛ بیتا بهبودیان* 2؛ سمانه دولت آبادی3 | ||
| 1کارشناسی ارشد ،گروه زیست شناسی، واحد علوم تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران | ||
| 2استادیار ،گروه علوم دامی، واحد کاشمر، دانشگاه آزاد اسلامی کاشمر، ایران | ||
| 3دانشیار ،گروه میکروبیولوژی، واحد نیشابور، دانشگاه آزاد اسلامی نیشابور، ایران | ||
| چکیده | ||
| مقدمه: سودوموناس آئروژینوزا یک پاتوژن فرصت طلب است که باعث ایجاد عفونت های مختلف به خصوص در بیماران بستری در بخش های مراقبت های ویژه می شود. مقاومت آنتی بیوتیکی و تولید بیوفیلم به عنوان دو عامل مهم در پاتوژنز این باکتری شناخته شده است. روش‌ها: 150 نمونه بالینی از بیماران بیمارستان قوچان جمع آوری شد. جدایه‌ها بر اساس روش‌های استاندارد میکروبیولوژیکی و بیوشیمیایی شناسایی و جداسازی شدند. بررسی مقاومت چند دارویی Multidrug resistant) :MDR) به روش دیسک دیفیوژن انجام شد. از تکنیک PCR) polymerase chain reaction) برای شناسایی ژن های algD, lasR و rhlR استفاده شد. یافته‌ها: مطابق نتایج به دست آمده درصد مقاومت نسبت به آنتی‌بیوتیک سفکسیم86 درصد و جنتامایسین ۷۲ درصد بود. کمترین درصد مقاومت نسبت به سفیپیم با 34 درصد گزارش شد. ۲۰ جدایه، نسبت به ایمی پنم و مروپنم غیر حساس بودند. 60 درصد از جدایه ها فنوتیپ MDR داشتند. 100 درصد جدایه‌ها حامل ژن algD، 90 درصد جدایه‌ها ژن rhlR و در نهایت 95 درصد از جدایه ها حامل ژن lasR بود. نتیجه‌گیری: نتایج نشان‌دهنده حضور بالای ژن‌های algD، rhlR و lasR در جدایه‌های سودوموناس آئروژینوزا بود. شیوع بالای ژن های در گیر در سیگنال دهی و تولید بیوفیلم، ویرولانس و اثر دهی آنتی بیوتیکی را نیز تحت تاثیر قرار می دهد. عفونت های مرتبط با بیوفیلم سودوموناس آئروژینوزا به عنوان یک مشکل بزرگ در درمان آنتی بیوتیکی در نظر گرفته می شود. در این راستا، جایگزین های دیگری مانند کاندیداهای ضد بیوفیلم یا ضد ویروسی مورد نیاز است. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| بیوفیلم؛ سودوموناس آئروژینوزا؛ مقاومت دارویی algD؛ rhlR و lasR | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Molecular characterization of algD, lasR, and rhlR genes in Pseudomonas aeruginosa isolated from hospitalized patients | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Hossein Adheem khoman1؛ Bita Behboodian2؛ Samane Dolatabadi3 | ||
| 1MSC. Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University Tehran, Iran | ||
| 2Professor. Department of Animal Science, Kashmar Branch, Islamic Azad University, Kashmar, Iran | ||
| 3Assistant Professor.Department of Microbiology, Neyshabur branch Islamic Azad Univercity, Neyshabur, Iran | ||
| چکیده [English] | ||
| Background: Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen that causes various infections, especially in patients hospitalized in intensive care units. Antibiotic resistance and biofilm production are known as two important factors in the pathogenesis of this bacterium. Methods: 150 clinical samples were collected from patients of Quchan Hospital, the isolates were identified and isolated based on standard microbiological and biochemical methods. Investigation of multidrug resistance (MDR) was done by disk diffusion method. PCR (polymerase chain reaction) technique was used to identify algD, lasR and rhlR genes. Findings: According to the obtained results, the percentage of resistance to cefixime antibiotic was 86% and gentamicin was 72%. The lowest percentage of resistance to cefepime was reported with 34%. 20 isolates were insensitive to imipenem and meropenem. 60% of isolates had MDR phenotype. 100% of the isolates carried the algD gene, 90% of the isolates carried the rhlR gene, and finally 95% of the isolates carried the lasR gene. Conclusion: The results showed high presence of algD, rhlR and lasR genes in Pseudomonas aeruginosa isolates. The high prevalence of genes involved in signaling and biofilm production also affects virulence and antibiotic effectiveness. Pseudomonas aeruginosa biofilm-related infections are considered a major problem in antibiotic therapy. In this regard, other alternatives such as anti-biofilm or antiviral candidates are needed. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Pseudomonas aeruginosa, algD, rhlR and lasR, MDR, biofilm | ||
| مراجع | ||
|
Aghamollaei H, Azizi Barjini K, Moosazadeh Mogaddam M. Rapid detection of Pseudomonas aeruginosa by PCR method using specific primers of quorum sensing lasI gene. Armaghane-danesh (YUMSJ). ; 18(9): 722-735. 2014. (In Persian). Ammazzalorso, A., Granese, A., & De Filippis, B. (2024). Recent trends and challenges to overcome Pseudomonas aeruginosa infections. Expert Opinion on Therapeutic Patents, 34(6), 493–509. https://doi.org/10.1080/13543776.2024.2348602 Blanco-Cabra, N., Paetzold, B., Ferrar, T., Mazzolini, R., Torrents, E., Serrano, L., & LLuch-Senar, M. (2020). Characterization of different alginate lyases for dissolving Pseudomonas aeruginosa biofilms. Scientific Reports, 10(1), 1–10. https://doi.org/10.1038/s41598-020-66293-2 Costa, E., Matos, O. De, Andriolo, R. B., Rodrigues, Y. C., Valéria, K., & Lima, B. (2018). Review Article Mortality in patients with multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa infections : a meta-analysis. 51(4), 415–420. https://doi.org/10.1590/0037-8682-0506-2017 CLSI supplement M100. Clinical and Laboratory Standards Institute; 2021. https://www.treata.academy/wp-content/uploads/2021/03/CLSI-31-2021.pdf Dejsirilert, S., Suankratay, C., Trakulsomboon, S., Thongmali, O., Sawanpanyalert, P., Aswapokee, N., & Tantisiriwat, W. (2009). National Antimicrobial Resistance Surveillance, Thailand (NARST) data among clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa in Thailand from 2000 to 2005. Journal of the Medical Association of Thailand = Chotmaihet Thangphaet, 92 Suppl 4(May 2014). El-Khashaab, T. H., Erfan, D. M., & Kamal, A. (2016). Pseudomonas Aeruginosa Biofilm Formation and Quorum Sensing lasR Gene in Patients with Wound Infection. The Egyptian Journal of Medical Microbiology, 25(1), 101–108. https://doi.org/10.12816/0037098 Elnegery, A. A., Mowafy, W. K., Zahra, T. A., & El-Khier, N. T. A. (2021). Study of quorum-sensing LasR and RhlR genes and their dependent virulence factors in Pseudomonas aeruginosa isolates from infected burn wounds. Access Microbiology, 3(3), 000211. https://doi.org/10.1099/ACMI.0.000211 Ghanem, S. M., Abd El-Baky, R. M., Abourehab, M. A., Fadl, G. F., & Gamil, N. G. (2023). Prevalence of Quorum Sensing and Virulence Factor Genes Among Pseudomonas aeruginosa Isolated from Patients Suffering from Different Infections and Their Association with Antimicrobial Resistance. Infection and Drug Resistance, 16, 2371–2385. https://doi.org/10.2147/IDR.S403441 Gill, J., Arora, S., Khanna, S., & Kumar, K. V. S. (2016). Prevalence of multidrug-resistant, extensively drug-resistant, and pandrug-resistant Pseudomonas aeruginosa from a tertiary level Intensive Care Unit. Journal of Global Infectious Diseases, 8(4), 155–159. https://doi.org/10.4103/0974-777X.192962 Groleau, M. C., Taillefer, H., Vincent, A. T., Constant, P., & Déziel, E. (2022). Pseudomonas aeruginosa isolates defective in function of the LasR quorum sensing regulator are frequent in diverse environmental niches. Environmental Microbiology, 24(3), 1062–1075. https://doi.org/10.1111/1462-2920.15745 Hassuna, N. A., Mandour, S. A., & Mohamed, E. S. (2020). Virulence Constitution of Multi-Drug-Resistant Pseudomonas aeruginosa in Upper Egypt Virulence Constitution of Multi-Drug-Resistant Pseudomonas aeruginosa in Upper Egypt. https://doi.org/10.2147/IDR.S233694 Kamali, E., Jamali, A., Ardebili, A., Ezadi, F., & Mohebbi, A. (2020). Evaluation of antimicrobial resistance, biofilm forming potential, and the presence of biofilm-related genes among clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa. BMC Research Notes, 13(1), 4–9. https://doi.org/10.1186/s13104-020-4890-z Keegan, N. R., Colón Torres, N. J., Stringer, A. M., Prager, L. I., Brockley, M. W., McManaman, C. L., … Paczkowski, J. E. (2023). Promoter selectivity of the RhlR quorumsensing transcription factor receptor in Pseudomonas aeruginosa is coordinated by distinct and overlapping dependencies on C4- homoserine lactone and PqsE. PLoS Genetics, 19(12), 1–26. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1010900 Kim, Y. A., Park, Y. S., Youk, T., Lee, H., & Lee, K. (2018). Correlation of aminoglycoside consumption and amikacin- or gentamicin-resistant pseudomonas aeruginosa in long-Term nationwide analysis: Is antibiotic cycling an effective policy for reducing antimicrobial resistance? Annals of Laboratory Medicine, 38(2), 176–178. https://doi.org/10.3343/alm.2018.38.2.176 Koleri, J., Petkar, H. M., Hussam, H. A., & Muna, M. A. (2023). Candida auris Blood stream infection- a descriptive study from Qatar. BMC Infectious Diseases, 23(1), 1–7. https://doi.org/10.1186/s12879-023-08477-5 Liao, C., Huang, X., Wang, Q., Yao, D., & Lu, W. (2022). Virulence Factors of Pseudomonas Aeruginosa and Antivirulence Strategies to Combat Its Drug Resistance. 12(July), 1–17. https://doi.org/10.3389/fcimb.2022.926758 Magiorakos, A. P., Srinivasan, A., Carey, R. B., Carmeli, Y., Falagas, M. E., Giske, C. G., … Monnet, D. L. (2012). Multidrug-resistant, extensively drug-resistant and pandrug-resistant bacteria: An international expert proposal for interim standard definitions for acquired resistance. Clinical Microbiology and Infection, 18(3), 268–281. https://doi.org/10.1111/j.1469-0691.2011.03570.x Maurice, N. M., Bedi, B., & Sadikot, R. T. (2018). TRANSLATIONAL REVIEW Pseudomonas aeruginosa Bio fi lms : Host Response and Clinical Implications in Lung Infections. 58(4), 428–439. https://doi.org/10.1165/rcmb.2017-0321TR Mohan, M.S., Salim, S.A., Forgia, N., Busi, S. (2024). Pseudomonas aeruginosa Virulence Factors and Biofilm Components: Synthesis, Structure, Function and Inhibitors. In: Busi, S., Prasad, R. (eds) ESKAPE Pathogens. Springer, Singapore. https://doi.org/10.1007/978-981-99-8799-3_11 Peymani, A., Farivar, T. N., Ghanbarlou, M. M., & Najafipour, R. (2015). Dissemination of Pseudomonas aeruginosa producing blaIMP-1 and blaVIM-1 in Qazvin and Alborz educational hospitals, Iran. Iranian Journal of Microbiology, 7(6), 302–309. Rajabi, H., Salimizand, H., Khodabandehloo, M., Fayyazi, A., & Ramazanzadeh, R. (2022). Prevalence of algD, pslD, pelF, Ppgl, and PAPI-1 Genes Involved in Biofilm Formation in Clinical Pseudomonas aeruginosa Strains. BioMed Research International, 2022. https://doi.org/10.1155/2022/1716087 Ratajczak, M., Kamińska, D., Nowak-Malczewska, D. M., Schneider, A., & Dlugaszewska, J. (2021). Relationship between antibiotic resistance , biofilm formation, genes coding virulence factors and source of origin of Pseudomonas aeruginosa clinical strains. Annals of Agricultural and Environmental Medicine, 28(2), 306–313. https://doi.org/10.26444/AAEM/122682 Resko, Z. J., Suhi, R. F., Thota, A. V., & Kroken, A. R. (2024). Evidence for intracellular Pseudomonas aeruginosa. Journal of Bacteriology, 206(5). https://doi.org/10.1128/jb.00109-24 Saravi, N. M., & Mousavi, T. (2022). Multidrug-Resistant Virulence Genes in Isolates of Pseudomonas aeruginosa in Iranian Clinical Samples: A Review-Meta-Analysis. Journal of Mazandaran University of Medical Sciences, 32(215), 176–188. Scoffone V. C., , Trespidi, G., Laurent R. Chiarelli, L. R., Barbieri G., and Buroni S. (2019). Quorum Sensing as Antivirulence Target in Cystic Fibrosis Pathogens. Int. J. Mol. Sci. 2019, 20, 1838. Shah, D. A., Wasim, S., & Abdullah, F. E. (2015). Antibiotic resistance pattern of Pseudomonas aeruginosa isolated from urine samples of Urinary Tract Infections patients in Karachi, Pakistan. Pakistan Journal of Medical Sciences, 31(2), 341–345. https://doi.org/10.12669/pjms.312.6839 Tuon, F. F., Dantas, L. R., Suss, P. H., & Tasca Ribeiro, V. S. (2022). Pathogenesis of the Pseudomonas aeruginosa Biofilm: A Review. Pathogens, 11(3). https://doi.org/10.3390/pathogens11030300 Vaez, H., Salehi-Abargouei, A., Ghalehnoo, Z. R., & Khademi, F. (2018). Multidrug resistant Pseudomonas aeruginosa in Iran: A systematic review and metaanalysis. Journal of Global Infectious Diseases, 10(4), 212–217. https://doi.org/10.4103/jgid.jgid_113_17 Zupetic, J., Peñaloza, H. F., Bain, W., Hulver, M., Mettus, R., Jorth, P., … Lee, J. S. (2021). Elastase Activity From Pseudomonas aeruginosa Respiratory Isolates and ICU Mortality. Chest, 160(5), 1624–1633. https://doi.org/10.1016/j.chest.2021.04.015
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 19 |
||