دانشگاه الزهرا

  اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات25
تعداد شماره‌ها938
تعداد مقالات7,697
تعداد مشاهده مقاله12,624,750
تعداد دریافت فایل اصل مقاله8,986,852
شاه عباسی, ندا, غفاریان, سارا. (1403). همراهی چندشکلی ژن ERCC5 (rs1047768 ) با استعداد ابتلا به سرطان پستان در شمال‌غرب ایران. جلوه هنر, 37(4), -. doi: 10.22051/jab.2024.45923.1605
ندا شاه عباسی; سارا غفاریان. "همراهی چندشکلی ژن ERCC5 (rs1047768 ) با استعداد ابتلا به سرطان پستان در شمال‌غرب ایران". جلوه هنر, 37, 4, 1403, -. doi: 10.22051/jab.2024.45923.1605
شاه عباسی, ندا, غفاریان, سارا. (1403). 'همراهی چندشکلی ژن ERCC5 (rs1047768 ) با استعداد ابتلا به سرطان پستان در شمال‌غرب ایران', جلوه هنر, 37(4), pp. -. doi: 10.22051/jab.2024.45923.1605
شاه عباسی, ندا, غفاریان, سارا. همراهی چندشکلی ژن ERCC5 (rs1047768 ) با استعداد ابتلا به سرطان پستان در شمال‌غرب ایران. جلوه هنر, 1403; 37(4): -. doi: 10.22051/jab.2024.45923.1605

همراهی چندشکلی ژن ERCC5 (rs1047768 ) با استعداد ابتلا به سرطان پستان در شمال‌غرب ایران

زیست شناسی کاربردی
مقاله 3، دوره 37، شماره 4 - شماره پیاپی 82، دی 1403
نوع مقاله: مقاله پژوهشی
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22051/jab.2024.45923.1605
نویسندگان
ندا شاه عباسی1؛ سارا غفاریان* 2
1فارغ التحصیل کارشناسی ارشد زیست شناسی سلولی و مولکولی دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، تبریز،
2استادیار گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، تبریز، ایران
چکیده
مقدمه: ترمیم برش نوکلئوتیدی (NER) یک مکانیسم کلیدی ترمیم DNA است و ژن ERCC5 یکی از اجزای کلیدی این مسیر، یک اندونوکلئاز ویژه با ساختار 1168 آمینواسیدی را کد می‌کند. در این مطالعه همراهی چندشکلی rs1047768 T>C ژن ERCC5 با استعداد ابتلا به سرطان پستان در زنان شمال غرب ایران مورد بررسی قرار گرفت.
روش‌ها: در این مطالعه مورد-شاهدی، همراهی چندشکلی rs1047768 T>C ژن ERCC5 با استعداد ابتلا به سرطان پستان در جامعه آماری متشکل از 100 زن بیمار و 100 فرد سالم با تکنیک Tetra-ARMS PCR مورد بررسی قرار گرفت. تجزیه و تحلیل داده‌های حاصل با استفاده از برنامه‌ی آماری آنلاین javastat و نرم‌افزار SPSS نسخه‌ی 26 انجام ‌شد.
نتایج: فراوانی ژنوتیپ‌های CC ، TC و TT در بیماران به ترتیب 43/26، 83/44 و 73/28 درصد و فراوانی آن‌ها در افراد سالم به ترتیب 44/24، 55/15 و 60 درصد بود. تجزیه‌های آماری نشان دهنده همراهی معنی‌دار ژنوتیپ‌های TT (001/0 =P-value) (503/0- 144/0=, CI 95% 269/0=OR) و TC با سرطان پستان (001/0 =P-value) (967/8- 169/2=, CI 95% 411/4/0=OR) بود. فراوانی آلل‌های C و T در بیماران به ترتیب 85/48 و 14/51 درصد بود. در جمعیت کنترل فراوانی آلل‌های C و T به ترتیب 22/32 و 77/67 درصد بود. نتایج حاصل نشان دهنده همراهی فراوانی دو آلل T (001/0 =P-value) و C (001/0 =P-value) با ریسک ابتلا به سرطان پستان بود. همراهی ویژگی‌های پاتولوژیکی افراد بیمار با توزیع ژنوتیپی این SNP معناداری نبود.
بحث: براساس نتایج این چندشکلی می‌تواند باعث افزایش ریسک ابتلا به سرطان پستان در شمال غرب ایران شود.
کلیدواژه‌ها
ترمیم برش نوکلئوتیدی؛ چند شکلی تک نوکلئوتیدی؛ ژن XPG؛ مطالعه مورد-شاهدی؛ ویژگی‌های بالینی
عنوان مقاله [English]
Association Between ERCC5 Gene Polymorphism (rs1047768) and the Risk of Breast Cancer in Northwest of Iran
نویسندگان [English]
Neda ShahAbbasi1؛ Sara Ghaffarian2
1MSc graduate, Department of Cellular and Molecular Biology, Faculty of Sciences, Azarbaijan Shahid Madani University, Tabriz, Iran
22. Assistant Professor, Department of Cellular and Molecular Biology, Faculty of Sciences, Azarbaijan Shahid Madani University, Tabriz, Iran
چکیده [English]
Introduction: Nucleotide Excision Repair (NER) is a key mechanism in DNA repair, and the ERCC5 gene, is one of the key components of this pathway, which encodes a special endonuclease with 1168 amino acids. In this research we studied the association of rs920778 C>T single nucleotide polymorphism of ERCC5 gene with the risk of breast cancer in northwest Iran.
Material and methods: In this case-control study, the association of ERCC5 (rs920778 C>T) gene polymorphism with breast cancer susceptibility was studied in a statistical population consisting of 100 patients and 100 healthy controls by Tetra-ARMS PCR. Statistical analysis was performed using javastat online statistics package and SPSS V.26.
Results: In the case group, the frequency of CC, CT, and TT genotypes were 26.43%, 44.83%, and 28.73%, respectively and they were 24.44%, 15.55%, and 60% for the control group. Statistical analysis showed a significant association between TT genotype (p-value=0.000) (OR=0.269, CI 95%=0.144-0.503) and CT genotype (p-value=0.000) (OR=4.411, CI 95%=2.169-8.967) with breast cancer risk. Also, C and T allele frequency in case group, was 48.85% and 51.14% and them in the control group were 32.22% and 67.77% respectively. There was a significant association between T (p-value=0.001) and C (p-value=0.001) allele frequency and breast cancer risk in Northwestern Iran. There was no significant association between this SNP frequency and patient’s pathological traits.
Conclution: These findings suggest that this SNP may contribute to the susceptibility of breast cancer in northwestern Iran.
کلیدواژه‌ها [English]
Case-Control study, Nucleotide excision Repair, Pathological traits, Single Nucleotide Polymorphism, XPG gene
مراجع
  1. Sung, H., Ferlay, J.,   Siegel, R.L., Laversanne, M., Soerjomataram, I., Jemal, A. and Bray, F. (2021). Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries. A Cancer Journal for Clinician, 71: 209-249.  10.3322/caac.21660.
  2. Ghoncheh, M., Pournamdar, Z. and Salehiniya, H. (2016). Incidence and mortality and epidemiology of breast cancer in the world. Asian Pacific Journal of Cancer Prevention, 17: 43-46. 10.7314/apjcp.2016.17.s3.43 .
  3. Ramos, J., Ruiz, A., Colen, R., Lopez, L.D., Grossman, L. and  Matta, J.L. (2004). DNA repair and breast carcinoma susceptibility in women.  Iinternational journal of the American Cancer Society, 100:1352-1357. 10.1002/cncr.20135.
  4. Chatterjee, N. and Walker, G.C. (2017). Mechanisms of DNA damage, repair and mutagenesis. Environmental and Molecular Mutagenesis, 58:235–263. 10.1002/em.22087.
  5. Wakasugi, W., Reardon, J.T. and Sancar, A. (1997). The non-catalytic function of XPG protein during dual incision in human nucleotide excision repair. Journal of Biological Chemistry, 272: 16030-16034. 10.1074/jbc.272.25.16030.
  6. Friedberg, E.C. and Zaher, H. (2021). DNA repair: Nucleotide excision repair: Biology. Pages 244-248 in  Lennarz, WJ and Lane MD, ed. Encyclopedia of Biological Chemistry 3rd edn.  Amsterdam: Elsevier. 10.1016/B978-0-12-819460-7.00043-8.
  7. Lehmann, A.R. (2003). Nucleotide excision repair syndromes: xeroderma pigmentosum, Cockayne syndrome, and trichothiodystrophy. Pages 211-237 Vogelstein B and Kinzler KW, ed. The Genetic Basis of Human Cancer New York: McGraw-Hill. https://doi.org/10.1016/j.biochi.2003.09.010

10.1001/archderm.1994.01690080084012

9.Thorel, F., Constantinou, A., Dunand-Sauthier, I., Nouspikel, T., Lalle, P., Raams, A., Jaspers, N.G.J.,  Vermeulen, W., Shivji, M.K.K.,  Wood, R.D. and  Clarkson, S.G. (2004). Definition of a short region of XPG necessary for TFIIH interaction and stable recruitment to sites of UV damage. Cellular and molecular biology, 24: 10670–10680. 10.1128/MCB.24.24.10670-10680.2004

  1. He, Z.G., Henricksen, L.A., Wold, M.S. and Ingles, C.J. (1995). Rpa Involvement in the Damage-Recognition and Incision Steps of Nucleotide Excision-Repair. Nature, 374: 566-569. https://doi.org/10.1038/374566a0
  2. Dunand-Sauthier, I., Hohl, M., Thorel, F., Jaquier-Gubler, P., Clarkson, S.G. and Schärer, O.D. (2005). The spacer region of XPG mediates recruitment to nucleotide excision repair complexes and determines substrate specificity. Journal of biological chemistry, 280: 7030–7037. https://doi.org/10.1074/jbc.M412228200
  3. Collins F.S., Guyer, M.S. and Charkravarti, A. (1997). A map of human genome sequence variation containing 1.42 million single nucleotide polymorphisms. Science, 409: 580–1581. https://doi.org/10.1038/35057149
  4. Na, N., Dun, E., Ren, L. and Li, G. (2015). Association between ERCC5 gene polymorphisms and breast cancer risk.” International Journal of Clinical and Experimental Pathology, 8: 3192-3197. PMCID: PMC4440148
  5. Zavras, A.I., Yoon, A.J., Chen, M. WenLin, C. and Yang, S. (2012). Association between polymorphisms of DNA repair gene ERCC5 and oral squamous cell carcinoma. Oral surgery, oral medicine, oral pathology oral radiology, 114: 624-629. 10.1016/j.oooo.2012.05.013
  6. kolyadina, I.V., Zavarykina, T., Lomskova, P., Gordeeva, O, Kapralova, M., Inna Ganshina, I., and Victorovna, S. (2023).    The polymorphic markers of the XRCC1, ERCC5, TP53, CDKN1A1 genes and the survival of triple negative breast cancer patients after platinum-based chemotherapy. Journal of Clinical Oncology, 41. https://doi.org/10.1200/JCO.2023.41.16_suppl.e12556
  7. Suguna, S., Nandal, D.H., Kamble, S., Bharatha, A. and Kunkulol, R. (2014). Genomic DNA isolation from human whole blood samples by non enzymatic salting out method. International Journal of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, 6: 198-199. url={https://api.semanticscholar.org/CorpusID:86014607}

 

  1. Malik, S.S., Mubarik, S., Masood, N. and Khadim M.T. (2018). An insight into clinical outcome of XPG polymorphisms in breast cancer. Molecular Biology Reports, 45: 2369-2375. 10.1007/s11033-018-4401-7
  2. Lan, X., Li,  Y., Wu, Y.,  Li, X. and Xu, L. (2022). The Association of ERCC1 and ERCC5 Polymorphisms with Lung Cancer Risk in Han Chinese. Journal of Cancer, 13: 517-526. 10.7150/jca.59277
  3. Huang, S., He, A., Xie, N., Xu D., Chen, Q. and Suwen, Qi S. (2018). Associations between seven polymorphisms in ERCC5 and gastric cancer susceptibility: a systematic review and meta-analysis. International journal of clinical and experimental medicine, 11: 3043-3050. IJCEM0063709
  4. Rao, K.S., Paul, A. and Kumar, A.S.A. (2014). Gurusamy Umamaheswaran1, Biswajit Dubashi2, Karunanithi Gunaseelan3 and Steven Aibor Dkhar. Allele and Genotype Distributions of DNA Repair Gene Polymorphisms in South Indian Healthy Population. Biomarkers in Cancer, 6: 29-35. 10.4137/BIC.S19681

 

 

 

 

آمار
تعداد مشاهده مقاله: 44


سامانه مدیریت نشریات علمی. طراحی و پیاده سازی از سیناوب